I cani malati sono meno restistenti allo sforzo, si affaticano subito e tossiscono frequentemente. Con l'aggravarsi della patologia compaiono anche edemi nelle zampe e nell'addome (ascite).
Le fasi terminali sono caratterizzate da difficoltà a respirare (dispnea) e urine scure, color caffè (emoglobinuria).

Nel gatto, vista la sua maggiore resistenza, la sintomatologia è meno evidente e compare solo quando la malattia è nella sua fase finale e causa quindi gravi squilibri. Dalla comparsa dei primi problemi respiratori e, a volte, vomito, alla morte improvvisa dell'animale passano pochi giorni o poche ore.

E' quindi facile capire perchè la prevenzione sia tanto importante: i sintomi, primi campanelli dall'allarme, compaiono solo nelle ultime drammatiche fasi della filariosi cardiopolmonare, quando ormai non c'è più tempo per intervenire ed aiutare i nostri amici.
Questo è particolarmente vero nel gatto in cui, non solo la terapia è spesso pericolosa, ma anche ci accorgiamo sempre troppo tardi.